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行(xíng)業(yè)動态 行(xíng)業(yè)動态

分(fēn)享|注意PCR 技(jì)術(shù)的(de÷∞•)“易污染陷阱”!

2024-11-15 作(zuò)者: 浏覽數(shù):754

聚合酶鏈式反應(PCR技(jì)術(shù))又(yòu)稱無∑Ω €細胞分(fēn)子(zǐ)克隆法,它的(de)鼎鼎大λ•₹β(dà)名在分(fēn)子(zǐ)生(s♥φhēng)物(wù)學領域可(kě)謂如(rú)雷貫™₹±耳,近(jìn)年(nián)來(lái ₩γ•)無論是(shì)如(rú)日(rì)中天的(de)精準醫(€αyī)療,還(hái)是(shì)穩步發展的(de)基因診斷都(dōuα®)離(lí)不(bù)開(kāi)PCR技(jìλ€₽)術(shù)這(zhè)位“老(lǎo)母親”。對(duì)于檢驗檢測≈α' 行(xíng)業(yè)的(de)小(xiǎo)夥伴來(l≠βái)說(shuō),PCR技(jì)術(shù)也(yě)絕對(duì)₽§能(néng)夠稱得(de)上(shànε£×g)是(shì)我們的(de)“好(hǎo)幫手”了(le)ε≈。尤其是(shì)緻病菌檢測、動物(wù)源性鑒定什(sh∏←¥én)麽的(de),毫無壓力。

然而當我們真正做(zuò)好(hǎo)準備上(shàng)機(jī)操≤$α作(zuò)時(shí),卻發現(xiàn)不(bù)是(s∞‍™hì)那(nà)麽回事(shì)兒(ér),總<"是(shì)有(yǒu)這(zhè)樣那(nà)樣的(de)↑₹♣原因導緻檢測結果有(yǒu)誤差。今天我們就(jiù)來(lái)×♦€好(hǎo)好(hǎo)分(fēn)析這(zhè)位“老(lǎo)母親”"¥的(de)脾氣。

PCR反應的(de)最大(dà)特點是(shì)→®♠具有(yǒu)較大(dà)擴增能(néng)力與極高(gāo)的(d¥δe)靈敏性,但(dàn)令人(rén)頭痛的(de)問(wèn)題是±&≠(shì)易污染,極其微(wēi)量的(de)污 ™染即可(kě)造成假陽性的(de)産生(shēng)。

【壹】
污染原因

1、标本間(jiān)交叉污染:

标本污染主要(yào)有(yǒu)收集标本的(d↕↓$e)容器(qì)被污染,或标本放(fàng)置時(shí)≠±,由于密封不(bù)嚴溢于容器(qì)外(wài),或容器≤"(qì)外(wài)粘有(yǒu)标本而造成相(xiàng)互間•'€(jiān)交叉污染;标本核酸模闆在提取過程中,由✔↔于吸樣槍污染導緻标本間(jiān)污染;有(yǒu)些∞♣(xiē)微(wēi)生(shēng)物(wù)标本尤其是(shì)病←§毒可(kě)随氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導緻彼此間(<£​jiān)的(de)污染。

2、PCR試劑的(de)污染:

主要(yào)是(shì)由于在PCR試劑配制(zε¶​hì)過程中,由于加樣槍、容器(qì)、雙蒸水(s•≈huǐ)及其它溶液被PCR核酸模闆污染。

3、PCR擴增産物(wù)污染:

這(zhè)是(shì)PCR反應中最主要(yào)最常見(jiàn>₹)的(de)污染問(wèn)題,因為(wèi)PCR産物(wù)拷貝♥∞‌÷量大(dà)(一(yī)般為(wèi)10α™✘13拷貝/mL),遠(yuǎn)遠(yuǎn)高(★≠gāo)于PCR檢測數(shù)個(gè)拷貝的(de)極限,所以←δλ極微(wēi)量的(de)PCR産物(wù)污染,就(jiù)可(kě)造成♠→₩假陽性。 

還(hái)有(yǒu)一(yī)種容易忽¶€≥視(shì),最可(kě)能(néng)造成↓™₹βPCR産物(wù)污染的(de)形式是(shì)氣溶膠污染;在空( >'<kōng)氣與液體(tǐ)面摩擦時(shí)就(jiù♥‍&β)可(kě)形成氣溶膠,在操作(zuò)時(sh$ í)比較劇(jù)烈地(dì)搖動反應管,開(kāi)蓋時♣£(shí)、吸樣時(shí)及污染進樣槍的(d±<e)反複吸樣都(dōu)可(kě)形成氣溶膠而污染。據計(jì)算(suπ£•àn)一(yī)個(gè)氣溶膠顆粒可(kě)¥$含48000拷貝,因而由其造成的(de)污染是(shì)一(yī)π∏✘₽個(gè)值得(de)特别重視(shì)的(de)問(wèn)題。

4、實驗室中克隆質粒的(de)污染:

在分(fēn)子(zǐ)生(shēng)物(wù)學實驗δ>室及某些(xiē)用(yòng)克隆質粒做(zuò)陽性對(duì)照(  Ω≈zhào)的(de)檢驗室,這(zhè)個(gè)問(w<∞èn)題也(yě)比較常見(jiàn)。因為(wèi)克隆質粒在• ≥單位容積內(nèi)含量相(xiàng)當高(gππāo),另外(wài)在純化(huà)過₩∏ 程中需用(yòng)較多(duō)的(de)用(yòng)具∞π>及試劑,而且在活細胞內(nèi)的(de)質σ↔♦♦粒,由于活細胞的(de)生(shēng)長(cháng)繁殖的(™$↕de)簡便性及具有(yǒu)很(hěn)強的(de)生(shēng)命力‌©,其污染可(kě)能(néng)性也(yě)很(hě₽↔n)大(dà)。  

5、對(duì)照(zhào)試驗 

a、陽性對(duì)照(zhào):在建立PCR反應實驗₹₽£♦室及一(yī)般的(de)檢驗單位都(dōu)應設有(yǒu)PCR♠→陽性對(duì)照(zhào),它是(shìπλφ•)PCR反應是(shì)否成功、産物(wù)條帶→✔≠®位置及大(dà)小(xiǎo)是(shì)否合®≠✘乎理(lǐ)論要(yào)求的(de)一(yī)✘★個(gè)重要(yào)的(de)參考标志(zhì)。§₹♠←陽性對(duì)照(zhào)要(yào)選擇擴增度中等、重複←₽性好(hǎo),經各種鑒定是(shì)該産物 "₹‌(wù)的(de)标本,如(rú)以重組質粒為(wèi)陽性 ₽♥對(duì)照(zhào),其含量宜低(d™€≥ī)不(bù)宜高(gāo)(100以下(xià)個(gè)拷貝),但(dà✘®n)陽性對(duì)照(zhào)尤其是(shì)重組質粒"βε"及高(gāo)濃度陽性标本,其對(duì)檢測或擴增樣品污染的(d✘∏↔e)可(kě)能(néng)性很(hěn)大(dà)。因而當某一(÷£yī)PCR試劑經自(zì)己使用(yòng)穩定,檢±β•¥驗人(rén)員(yuán)心中有(yǒu)數(shù)時(shí),÷♠在以後的(de)實驗中可(kě)免設陽性對(duì<>₽)照(zhào)。

b、陰性對(duì)照(zhào):每次PCR實驗≠☆ 務必做(zuò)陰性對(duì)照(zhào)。它包括①标本對(d‍€↑uì)照(zhào):被檢的(de)标本是(↓δ‌shì)血清就(jiù)用(yòng)鑒ε♣≥≠定後的(de)正常血清作(zuò)對(duì)照(zhào);被εα★∏檢的(de)标本是(shì)組織細胞就(jiù)用(yòng)相(xi∑↑£àng)應的(de)組織細胞作(zuò)對(duì)照(z₽$≥≥hào)。②試劑對(duì)照(zhào):在≈§₹≥PCR試劑中不(bù)加模闆DNA或RNA,進行₹β(xíng)PCR擴增,以監測試劑是(shì)否污染。

【貳】
防止污染的(de)方法

1、合理(lǐ)分(fēn)隔實驗室:将樣品的(d✔ e)處理(lǐ)、配制(zhì)PCR反應液、PCR循環擴增及Pβ ‍CR産物(wù)的(de)鑒定等步驟分(fπε&εēn)區(qū)或分(fēn)室進行(xí€♥≤₹ng),特别注意樣本處理(lǐ)及産物(wù)的(de)鑒定等<€步驟分(fēn)區(qū)或分(fēn)室進行(∑×xíng),及PCR産物(wù)的(de)鑒定應與其它步驟嚴§ ♦£格分(fēn)開(kāi)。 

最好(hǎo)能(néng)劃分(fēn)①标本處理(lǐ)區(q↓σ‌✘ū);②PCR反應液制(zhì)備區(qū);③PCR循環擴增區€←≥×(qū);④PCR産物(wù)鑒定區(qū)。₩↓γ其實驗用(yòng)品及吸樣槍應專用(yòngφφ✘±),實驗前應将實驗室用(yòng)紫外(wài)線消毒以破壞εγ殘留的(de)DNA或RNA。

2、吸樣槍:吸樣槍污染是(shì)一(yī)個(gè)值得(dλ↑≈e)注意的(de)問(wèn)題。由于操作(zuò)時(s∞€hí)不(bù)慎将樣品或模闆核酸吸入槍內(nèi)或粘上(shàα↑ng)槍頭是(shì)一(yī)個(gè)嚴重的→↑(de)污染源,因而加樣或吸取模闆核酸時(s♠×hí)要(yào)十分(fēn)小(xiǎo)心,吸樣要(λα±yào)慢(màn),吸樣時(shí)盡量一(yī)次性完成,忌多(d¥§↔≤uō)次抽吸,以免交叉污染或産生(shēng δσ)氣溶膠污染。

3、預混和(hé)分(fēn)裝PCR試劑:所有(yǒu)的(de)PCR試劑≠Ω€"都(dōu)應小(xiǎo)量分(fēn)裝 ←✘σ,如(rú)有(yǒu)可(kě)能(néng),PCR反應液應預先配制(≠πzhì)好(hǎo),然後小(xiǎo)量分(fēn)裝,-20℃保存©♦。以減少(shǎo)重複加樣次數(shù),避免污染機(jī)會(huì)。↕£另外(wài),PCR試劑,PCR反應液應與樣品<∑及PCR産物(wù)分(fēn)開(kāi)保存,不(bù)應& 放(fàng)于同一(yī)冰盒或同一(yī)冰箱。 

4、防止操作(zuò)人(rén)員(yuán×←§)污染,使用(yòng)一(yī)次性手套、吸頭、小(xγ ¶✘iǎo)離(lí)心管應一(yī)次性使用(yòng)。

5、設立适當的(de)陽性對(duì)照(zhào<€∑)和(hé)陰性對(duì)照(zhào),φ♣✘陽性對(duì)照(zhào)以能(né↓§ng)出現(xiàn)擴增條帶的(de)₽☆∏最低(dī)量的(de)标準病原體(tǐ)核酸為(wèi)宜,并§✔注意交叉污染的(de)可(kě)能(néng)性,每次反應都(dōu)應有( ♣↔yǒu)一(yī)管不(bù)加模闆的(de)試劑φ≥對(duì)照(zhào)及相(xiàng)應不(bù)含★₩∞ 有(yǒu)被擴增核酸的(de)樣品作(zuò)陰性對(duì)照(←♠ε​zhào)。

6、減少(shǎo)PCR循環次數(shù),隻要(♦₩¶€yào)PCR産物(wù)達到(dào)檢測水(sh ≈§uǐ)平就(jiù)适可(kě)而止。

7、選擇質量好(hǎo)的(de)Eppen£•♦∞dorf管,以避免樣本外(wài)溢及外(wài)來(lái)核酸的(≠↓de)進入,打開(kāi)離(lí)心管前應先離(lí)心,将管壁及管蓋上(s↑♥hàng)的(de)液體(tǐ)甩至管底部。開↕>(kāi)管動作(zuò)要(yào)輕,→¥<以防管內(nèi)液體(tǐ)濺出。


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